Δολοφονική ενέργεια σε βάρος του Χριστόδουλου Ξηρού επρόκειτο να επιχειρήσουν, σύμφωνα με τις εκτιμήσεις των αστυνομικών, τα μέλη της «Συνωμοσίας Πυρήνων της Φωτιάς» καθώς έπειτα από δύο αποτυχημένες βομβιστικές επιθέσεις υπήρξε διάσταση μεταξύ τους, η οποία έφτασε μέχρι το σημείο να χαρακτηρίζουν το μέλος της «17 Νοέμβρη» προδότη.
Στις επικοινωνίες που είχαν οι έγκλειστοι της ΣΠΦ με ελεύθερα μέλη της οργάνωσης διαμέσου της 23χρονης καταζητούμενης Αγγελικής και οι οποίες γίνονταν με τη χρήση καρτών μνήμης που τοποθετούνται στα κινητά, σχεδίαζαν -όπως αναφέρουν οι αστυνομικοί- να χρησιμοποιήσουν τον Χριστόδουλο Ξηρό για την απόδραση και ύστερα από αυτή θα τον σκότωναν. «Θα τον χρησιμοποιήσουμε και μετά πάει για απόλυση», αναφέρουν χαρακτηριστικά οι αστυνομικοί ότι έγραφαν σε μήνυμά τους.
Η ρήξη μεταξύ του Χριστόδουλου Ξηρού και των μελών της ΣΠΦ είχε επέλθει μετά τις αποτυχημένες ενέργειες σε βάρος της Εφορίας στον Κορυδαλλό και του Αστυνομικού Τμήματος Ιτέας.
Ο Ξηρός είχε αναλάβει την κατασκευή των βομβών και καθώς αυτές δεν εξερράγησαν οι «Πυρήνες» θεώρησαν ότι το λάθος οφείλεται σε αυτόν. Φαίνεται, δε, να ήταν τόσο δυσαρεστημένοι από τη μεταξύ τους συνεργασία ώστε σε μια επικοινωνία μέλος της ΣΠΦ ανέφερε ότι «είχε δίκιο ο Κουφοντίνας».
Εκτός αυτών, όπως ανέφερε στην παρουσίαση που έκανε για την υπόθεση ο αρχηγός της ΕΛ.ΑΣ αντιστράτηγος Δημήτρης Τσακνάκης, βρέθηκαν δαχτυλικά αποτυπώματα και βιολογικό υλικό στα τάπερ που εντοπίστηκαν στην Περαχώρα Λουτρακίου, τα οποία ανήκουν στον Νταμιάνο Μπολάνο, στον Χρήστο Τσάκαλο και σε ακόμη έναν άνδρα του οποίου DNA βρέθηκε τον Οκτώβριο του 2009 στο διαμέρισμα όπου διέμενε ο Χαρίλαος Χατζημιχελάκης στο Χαλάνδρι.
Τέλος, στο πλαίσιο των ερευνών συνελήφθη -εκτός από τον 23χρονο ομογενή στην Άνω Γλυφάδα- ένας 29χρονος Αλβανός στη Θεσσαλονίκη που φέρεται να έχει «στρατολογηθεί» στην οργάνωση από συμπατριώτη του, καταδικασμένο σε δις ισόβια για ανθρωποκτονίες, Αλβανό που κρατείται στον Κορυδαλλό.
