Απογοήτευση, έντονη διαμαρτυρία και προβληματισμό για τη μετατροπή της Αγίας Σοφίας σε χώρο λατρείας της Ισλαμικής Θρησκείας, εκφράζει η Εκκλησία της Ελλάδας.
Στην επίσημη ανακοίνωση της Ιεράς Συνόδου, η Εκκλησίας της Ελλάδος αναφέρει:
«Με την μετατροπή αυτή μεταβάλλεται το Μνημείο από χώρος πολιτισμού σε σημείο διχασμού και διασπάσεως».
Τονίζεται ότι το μνημείο αποτελεί κατ’ εξοχήν τμήμα του Χριστιανικού πολιτισμού και ότι η αξία του είναι οικουμενική. Η μετατροπή του σε τόπο μεμονωμένης λειτουργικότητας μίας θρησκείας αποδεικνύει πολιτισμικό έλλειμμα της γείτονος χώρας, ανέφερε η Εκκλησία, καθώς απομακρύνεται από τις ευρωπαϊκές αρχές της ειρήνης, της καταλλαγής και του σεβασμού στην ετερότητα.
Την έκκλησή της, απηύθυνε καταλήγοντας, προς όλο τον πνευματικό κόσμο, των Χριστιανικών Ομολογιών, τις υπόλοιπες Εκκλησίες, τις κυβερνήσεις και τους Διεθνής Οργανισμούς που υπερασπίζονται τις ίδιες αξίες, έτσι ώστε να ανακληθεί αυτή η απόφαση και να αποκατασταθεί η ορθή χρήση του μνημείου.
